WIsH: Who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage 
contigs.

Galiez, C.; Siebert, M.; Enault, F.; Vincent, J.; Söding, J.

doi:10.1093/bioinformatics/btx383

WIsH: Who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs.

Galiez, C., Siebert, M., Enault, F., Vincent, J., & Söding, J. (2017). WIsH: Who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs. Bioinformatics, 33(19), 3113-3114. doi:10.1093/bioinformatics/btx383.

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Siebert, M.¹, 著者
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所属:
1Research Group of Computational Biology, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_1933286

内容説明

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要旨: WIsH predicts prokaryotic hosts of phages from their genomic sequences. It achieves 63% mean accuracy when predicting the host genus among 20 genera for 3 kbp-long phage contigs. Over the best current tool, WisH shows much improved accuracy on phage sequences of a few kbp length and runs hundreds of times faster, making it suited for metagenomics studies.

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言語: eng - English

日付: オンライン出版: 2017-07-13出版: 2017-10-01

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種別: 学術雑誌

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