Deutsch
 
Hilfe Datenschutzhinweis Impressum
  DetailsucheBrowse

Datensatz

DATENSATZ AKTIONENEXPORT
  Mechanisms of backtrack recovery by RNA polymerases I and II.

Lisica, A., Engel, C., Jahnel, M., Roldán, É., Galburt, E. A., Cramer, P., et al. (2016). Mechanisms of backtrack recovery by RNA polymerases I and II. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 113(11), 2946-2951. doi:10.1073/pnas.1517011113.

Item is

Dateien

einblenden: Dateien
ausblenden: Dateien
:
2256138.pdf (Verlagsversion), 2MB
Name:
2256138.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-
:
2256138_Suppl.pdf (Ergänzendes Material), 2MB
Name:
2256138_Suppl.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-
:
2256138-Suppl.DCSupplemental (Ergänzendes Material), 41KB
Name:
2256138-Suppl.DCSupplemental
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/xhtml+xml / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-

Externe Referenzen

einblenden:
ausblenden:
externe Referenz:
http://www.pnas.org/content/113/11/2946.full.pdf (Verlagsversion)
Beschreibung:
-
OA-Status:

Urheber

einblenden:
ausblenden:
 Urheber:
Lisica, A., Autor
Engel, C.1, Autor           
Jahnel, M., Autor
Roldán, É., Autor
Galburt, E. A., Autor
Cramer, P.1, Autor           
Grill, S. W., Autor
Affiliations:
1Department of Molecular Biology, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_1863498              

Inhalt

einblenden:
ausblenden:
Schlagwörter: Pol I; Pol II; backtracking; optical tweezers; transcription
 Zusammenfassung: During DNA transcription, RNA polymerases often adopt inactive backtracked states. Recovery from backtracks can occur by 1D diffusion or cleavage of backtracked RNA, but how polymerases make this choice is unknown. Here, we use single-molecule optical tweezers experiments and stochastic theory to show that the choice of a backtrack recovery mechanism is determined by a kinetic competition between 1D diffusion and RNA cleavage. Notably, RNA polymerase I (Pol I) and Pol II recover from shallow backtracks by 1D diffusion, use RNA cleavage to recover from intermediary depths, and are unable to recover from extensive backtracks. Furthermore, Pol I and Pol II use distinct mechanisms to avoid nonrecoverable backtracking. Pol I is protected by its subunit A12.2, which decreases the rate of 1D diffusion and enables transcript cleavage up to 20 nt. In contrast, Pol II is fully protected through association with the cleavage stimulatory factor TFIIS, which enables rapid recovery from any depth by RNA cleavage. Taken together, we identify distinct backtrack recovery strategies of Pol I and Pol II, shedding light on the evolution of cellular functions of these key enzymes.

Details

einblenden:
ausblenden:
Sprache(n): eng - English
 Datum: 2016-03-15
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1073/pnas.1517011113
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

einblenden:

Entscheidung

einblenden:

Projektinformation

einblenden:

Quelle 1

einblenden:
ausblenden:
Titel: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 113 (11) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 2946 - 2951 Identifikator: -