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  Detection of Hopf bifurcations in chemical reaction networks using convex coordinates

Errami, H., Eiswirth, M., Grigoriev, D., Seiler, W. M., Sturm, T., & Weber, A. (2015). Detection of Hopf bifurcations in chemical reaction networks using convex coordinates. Journal of Computational Physics, 291, 279-302. doi:10.1016/j.jcp.2015.02.050.

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YJCPH_5760.pdf (beliebiger Volltext), 571KB
Name:
YJCPH_5760.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
2015
Copyright Info:
Elsevier
Lizenz:
-
:
2111778.pdf (Verlagsversion), 5MB
Name:
2111778.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
2015
Copyright Info:
Elsevier

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Errami, Hassan1, 2, Autor
Eiswirth, Markus3, 4, Autor           
Grigoriev, Dima5, Autor
Seiler, Werner M.2, Autor
Sturm, Thomas6, Autor           
Weber, Andreas1, Autor
Affiliations:
1Institut für Informatik II, Universität Bonn, Bonn, Germany, ou_persistent22              
2Institut für Mathematik, Universität Kassel, Kassel, Germany, ou_persistent22              
3Physical Chemistry, Fritz Haber Institute, Max Planck Society, ou_634546              
4Ertl Center for Electrochemisty and Catalysis, Gwangju Institute of Science and Technology (GIST), South Korea, ou_persistent22              
5CNRS, Mathematiques, Universite de Lille, Villeneuve d'Ascq, 59655, France, ou_persistent22              
6Automation of Logic, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_1116545              

Inhalt

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Schlagwörter: Hopf Bifurcation, Chemical Reaction Networks, Convex Coordinates, Stoichiometric Network Analysis
 Zusammenfassung: We present ecient algorithmic methods to detect Hopf bifurcation xed points in chemical reaction networks with symbolic rate constants, thereby yielding information about the oscillatory behavior of the networks. Our methods use the representations of the systems on convex coordinates that arise from stoichiometric network analysis. One of our methods then reduces the problem of determining the existence of Hopf bifurcation xed points to a rst-order formula over the ordered eld of the reals that can be solved using computational logic packages. The second method uses ideas from tropical geometry to formulate a more ecient method that is incomplete in theory but worked very well for the examples that we have attempted; we have shown it to be able to handle systems involving more than 20 species.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2015-02-242013-09-152015-02-242015-03-162015-06-15
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: 24
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1016/j.jcp.2015.02.050
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Journal of Computational Physics
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Amsterdam : Elsevier B.V.
Seiten: - Band / Heft: 291 Artikelnummer: - Start- / Endseite: 279 - 302 Identifikator: ISSN: 0021-9991
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954922645031