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  Electron density deformations provide new insights into the spectral shift of rhodopsins

Hernández-Rodríguez, E. W., Montero-Alejo, A. L., López, R., Sánchez-García, E., Montero-Cabrera, L. A., & García de la Vega, J. (2013). Electron density deformations provide new insights into the spectral shift of rhodopsins. Journal of Computational Chemistry, 34(28), 2460-2471. doi:10.1002/jcc.23414.

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Urheber

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 Urheber:
Hernández-Rodríguez, Erix Wiliam1, 2, 3, Autor
Montero-Alejo, Ana Lilian3, Autor
López, Rafael2, Autor
Sánchez-García, Elsa4, Autor           
Montero-Cabrera, Luis Alberto3, Autor
García de la Vega, José 2, Autor
Affiliations:
1Departamento de Bioquíımica, Instituto de Ciencias Básicas y Preclínicas“Victoria de Girón,” Universidad de Ciencias Médicas de La Habana, Havana 11600, Cuba, ou_persistent22              
2Departamento de Química Física Aplicada, Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma de Madrid, Madrid 28049, Spain, ou_persistent22              
3Laboratorio de Química Computacional y Teórica, Departamento de Química Física, Universidad de La Habana, Havana 10400, Cuba, ou_persistent22              
4Research Group Sánchez-García, Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Max Planck Society, Kaiser-Wilhelm-Platz 1, 45470 Mülheim an der Ruhr, DE, ou_1950289              

Inhalt

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Schlagwörter: rhodopsin; mutations; retinitis pigmentosa; electronic structure; electron density deformations
 Zusammenfassung: Spectral shifts of rhodopsin, which are related to variations of the electron distribution in 11-cis-retinal, are investigated here using the method of deformed atoms in molecules. We found that systems carrying the M207R and S186W mutations display large perturbations of the π-conjugated system with respect to wild-type rhodopsins. These changes agree with the predicted behavior of the bond length alternation (BLA) and the blue shifts of vertical excitation energies of these systems. The effect of the planarity of the central and Schiff-base regions of retinal chain on the electronic structure of the chromophore is also investigated. By establishing nonlinear polynomial relations between BLA, chain distortions, and vertical excitation energies, we are also able to provide a semiquantitative approach for the understanding of the mechanisms regulating spectral shifts in rhodopsin and its mutants.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2013-07-262013-06-042013-07-272013-08-262013-10-30
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: 12
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1002/jcc.23414
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Journal of Computational Chemistry
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: New York : Wiley
Seiten: 12 Band / Heft: 34 (28) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 2460 - 2471 Identifikator: ISSN: 0192-8651
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925489848