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  Combined sequence-based and genetic mapping analysis of complex traits in outbred rats

Baud, A., Hermsen, R., Guryev, V., Stridh, P., Graham, D., McBride, M. W., Foroud, T., Calderari, S., Diez, M., Ockinger, J., Beyeen, A. D., Gillett, A., Abdelmagid, N., Guerreiro-Cacais, A. O., Jagodic, M., Tuncel, J., Norin, U., Beattie, E., Huynh, N., Miller, W. H., Koller, D. L., Alam, I., Falak, S., Osborne-Pellegrin, M., Martinez-Membrives, E., Canete, T., Blazquez, G., Vicens-Costa, E., Mont-Cardona, C., Diaz-Moran, S., Tobena, A., Hummel, O., Zelenika, D., Saar, K., Patone, G., Bauerfeind, A., Bihoreau, M. T., Heinig, M., Lee, Y. A., Rintisch, C., Schulz, H., Wheeler, D. A., Worley, K. C., Muzny, D. M., Gibbs, R. A., Lathrop, M., Lansu, N., Toonen, P., Ruzius, F. P., de Bruijn, E., Hauser, H., Adams, D. J., Keane, T., Atanur, S. S., Aitman, T. J., Flicek, P., Malinauskas, T., Jones, E. Y., Ekman, D., Lopez-Aumatell, R., Dominiczak, A. F., Johannesson, M., Holmdahl, R., Olsson, T., Gauguier, D., Hubner, N., Fernandez-Teruel, A., Cuppen, E., Mott, R., & Flint, J. (2013). Combined sequence-based and genetic mapping analysis of complex traits in outbred rats. Nature Genetics, 45(7), 767-775. doi:10.1038/ng.2644.

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-7BEE-B 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-7BEF-9
資料種別: 学術論文

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Baud et al.pdf (出版社版), 1MB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-7BF0-3
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-
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© 2013 Nature Publishing Group
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 作成者:
Baud, A., 著者
Hermsen, R., 著者
Guryev, V., 著者
Stridh, P., 著者
Graham, D., 著者
McBride, M. W., 著者
Foroud, T., 著者
Calderari, S., 著者
Diez, M., 著者
Ockinger, J., 著者
Beyeen, A. D., 著者
Gillett, A., 著者
Abdelmagid, N., 著者
Guerreiro-Cacais, A. O., 著者
Jagodic, M., 著者
Tuncel, J., 著者
Norin, U., 著者
Beattie, E., 著者
Huynh, N., 著者
Miller, W. H., 著者
Koller, D. L., 著者Alam, I., 著者Falak, S., 著者Osborne-Pellegrin, M., 著者Martinez-Membrives, E., 著者Canete, T., 著者Blazquez, G., 著者Vicens-Costa, E., 著者Mont-Cardona, C., 著者Diaz-Moran, S., 著者Tobena, A., 著者Hummel, O., 著者Zelenika, D., 著者Saar, K., 著者Patone, G., 著者Bauerfeind, A., 著者Bihoreau, M. T., 著者Heinig, M.1, 著者           Lee, Y. A., 著者Rintisch, C., 著者Schulz, H., 著者Wheeler, D. A., 著者Worley, K. C., 著者Muzny, D. M., 著者Gibbs, R. A., 著者Lathrop, M., 著者Lansu, N., 著者Toonen, P., 著者Ruzius, F. P., 著者de Bruijn, E., 著者Hauser, H., 著者Adams, D. J., 著者Keane, T., 著者Atanur, S. S., 著者Aitman, T. J., 著者Flicek, P., 著者Malinauskas, T., 著者Jones, E. Y., 著者Ekman, D., 著者Lopez-Aumatell, R., 著者Dominiczak, A. F., 著者Johannesson, M., 著者Holmdahl, R., 著者Olsson, T., 著者Gauguier, D., 著者Hubner, N., 著者Fernandez-Teruel, A., 著者Cuppen, E., 著者Mott, R., 著者Flint, J., 著者 全て表示
所属:
1Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, Ihnestr. 73, 14195 Berlin, Germany, ou_1433547              

内容説明

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キーワード: Animals Animals, Outbred Strains Anxiety/*genetics Chromosome Mapping/*methods Genetic Variation/genetics Genotype Heart Diseases/*genetics Humans Mice Mice, Inbred C57BL Models, Molecular Multiple Sclerosis/*genetics Phenotype Polymorphism, Single Nucleotide Quantitative Trait Loci/genetics Rats Sequence Analysis, DNA/*methods
 要旨: Genetic mapping on fully sequenced individuals is transforming understanding of the relationship between molecular variation and variation in complex traits. Here we report a combined sequence and genetic mapping analysis in outbred rats that maps 355 quantitative trait loci for 122 phenotypes. We identify 35 causal genes involved in 31 phenotypes, implicating new genes in models of anxiety, heart disease and multiple sclerosis. The relationship between sequence and genetic variation is unexpectedly complex: at approximately 40% of quantitative trait loci, a single sequence variant cannot account for the phenotypic effect. Using comparable sequence and mapping data from mice, we show that the extent and spatial pattern of variation in inbred rats differ substantially from those of inbred mice and that the genetic variants in orthologous genes rarely contribute to the same phenotype in both species.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2013-05-262013-07
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1038/ng.2644
ISSN: 1546-1718 (Electronic)1061-4036 (Print)
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出版物 1

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出版物名: Nature Genetics
  その他 : Nature Genet.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Nature America, Inc.
ページ: - 巻号: 45 (7) 通巻号: - 開始・終了ページ: 767 - 775 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1061-4036
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925598609