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Datensatz

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  Global Biclustering of Microarray Data

Wolf, T., Brors B, Hofmann, T., & Georgii, E. (2006). Global Biclustering of Microarray Data. Proceedings of the Sixth IEEE International Conference on Data Mining - Workshops (ICDMW 2006), 125-129.

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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Wolf, T, Autor
Brors B, Hofmann, T1, Autor           
Georgii, E1, Autor           
Tsumoto, Herausgeber
S., Herausgeber
Clifton, C. W., Herausgeber
Zhong, N., Herausgeber
Wu, X., Herausgeber
Liu, J., Herausgeber
Wah, B. W., Herausgeber
Cheung, Y.-M., Herausgeber
Affiliations:
1Department Empirical Inference, Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Max Planck Society, ou_1497795              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: We consider the problem of simultaneously clustering genes and conditions of a gene expression data matrix. A bicluster is defined as a subset of genes that show similar behavior within a subset of conditions. Finding biclusters can be useful for revealing groups of genes involved in the same molecular process as well as groups of conditions where this process takes place. Previous work either deals with local, bicluster-based criteria or assumes a very specific structure of the data matrix (e.g. checkerboard or block-diagonal) [11]. In contrast, our goal is to find a set of flexibly arranged biclusters which is optimal in regard to a global objective function. As this is a NP-hard combinatorial problem, we describe several techniques to obtain approximate solutions. We benchmarked our approach successfully on the Alizadeh B-cell lymphoma data set [1].

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2006-12
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Titel: Sixth IEEE International Conference on Data Mining
Veranstaltungsort: Hong Kong, China
Start-/Enddatum: -

Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Proceedings of the Sixth IEEE International Conference on Data Mining - Workshops (ICDMW 2006)
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Los Alamitos, CA, USA : IEEE Computer Society
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: 125 - 129 Identifikator: -