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  A simple strand-specific RNA-Seq library preparation protocol combining the Illumina TruSeq RNA and the dUTP methods

Sultan, M., Dokel, S., Amstislavskiy, V., Wuttig, D., Sultmann, H., Lehrach, H., et al. (2012). A simple strand-specific RNA-Seq library preparation protocol combining the Illumina TruSeq RNA and the dUTP methods. Biochemical and Biophysical Research Communications, 422(4), 643-646. doi:10.1016/j.bbrc.2012.05.043.

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Sultan.pdf (Verlagsversion), 643KB
Name:
Sultan.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
© 2012 Elsevier Inc.
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Sultan, M.1, Autor           
Dokel, S., Autor
Amstislavskiy, V., Autor
Wuttig, D., Autor
Sultmann, H., Autor
Lehrach, H.2, Autor           
Yaspo, M. L.1, Autor           
Affiliations:
1Human Chromosome 21 (Marie-Laure Yaspo), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479652              
2Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433550              

Inhalt

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Schlagwörter: Deoxyuracil Nucleotides/*chemistry/genetics Gene Expression Profiling/*methods *Gene Library Humans Sequence Analysis, RNA/*methods Transcriptome
 Zusammenfassung: Preserving the original RNA orientation information in RNA-Sequencing (RNA-Seq) experiment is essential to the analysis and understanding of the complexity of mammalian transcriptomes. We describe herein a simple, robust, and time-effective protocol for generating strand-specific RNA-seq libraries suited for the Illumina sequencing platform. We modified the Illumina TruSeq RNA sample preparation by implementing the strand specificity feature using the dUTP method. This protocol uses low amounts of starting material and allows a fast processing within two days. It can be easily implemented and requires only few additional reagents to the original Illumina kit.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2012-05-152012-06-15
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.05.043
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Biochemical and Biophysical Research Communications
  Andere : Biochem. Biophys. Res. Commun.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Orlando, Fla. : Academic Press
Seiten: - Band / Heft: 422 (4) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 643 - 646 Identifikator: ISSN: 0006-291X
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954922652205_1