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  Maturation of mammalian H/ACA box snoRNAs: PAPD5-dependent adenylation and PARN-dependent trimming

Berndt, H., Harnisch, C., Rammelt, C., Stohr, N., Zirkel, A., Dohm, J. C., Himmelbauer, H., Tavanez, J. P., Hüttelmaier, S., & Wahle, E. (2012). Maturation of mammalian H/ACA box snoRNAs: PAPD5-dependent adenylation and PARN-dependent trimming. RNA-A Publication of the RNA Society, 18(5), 958-972. doi:10.1261/rna.032292.112.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Berndt.pdf (出版社版), 4MB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-F4E9-5
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Berndt.pdf
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-
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
© 2012 by the RNA Society
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Berndt, H., 著者
Harnisch, C., 著者
Rammelt, C., 著者
Stohr, N., 著者
Zirkel, A., 著者
Dohm, J. C.1, 2, 著者           
Himmelbauer, H.1, 2, 著者           
Tavanez, J. P., 著者
Hüttelmaier, S., 著者
Wahle, E., 著者
所属:
1Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, Berlin, Germany, ou_1433550              
2Centre for Genomic Regulation (CRG) and UPF, Barcelona, Spain , ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: Base Sequence Catalysis Cell Nucleolus/metabolism Coiled Bodies/metabolism Exoribonucleases/genetics/*metabolism Exosome Multienzyme Ribonuclease Complex Humans Nuclear Proteins/metabolism Nucleotide Motifs Polyadenylation Protein Transport RNA Editing RNA Nucleotidyltransferases/*metabolism RNA, Small Nucleolar/*chemistry/*metabolism
 要旨: Small nucleolar and small Cajal body RNAs (snoRNAs and scaRNAs) of the H/ACA box and C/D box type are generated by exonucleolytic shortening of longer precursors. Removal of the last few nucleotides at the 3' end is known to be a distinct step. We report that, in human cells, knock-down of the poly(A) specific ribonuclease (PARN), previously implicated only in mRNA metabolism, causes the accumulation of oligoadenylated processing intermediates of H/ACA box but not C/D box RNAs. In agreement with a role of PARN in snoRNA and scaRNA processing, the enzyme is concentrated in nucleoli and Cajal bodies. Oligo(A) tails are attached to a short stub of intron sequence remaining beyond the mature 3' end of the snoRNAs. The noncanonical poly(A) polymerase PAPD5 is responsible for addition of the oligo(A) tails. We suggest that deadenylation is coupled to clean 3' end trimming, which might serve to enhance snoRNA stability.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012-03-222012-05
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1261/rna.032292.112
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: RNA-A Publication of the RNA Society
  その他 : RNA-Publ. RNA Soc.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Cambridge University Press
ページ: - 巻号: 18 (5) 通巻号: - 開始・終了ページ: 958 - 972 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1355-8382
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925343776