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Datensatz

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  False discovery rate estimation for cross-linked peptides identified by mass spectrometry

Walzthoeni, T., Claassen, M., Leitner, A., Herzog, F., Bohn, S., Förster, F., et al. (2012). False discovery rate estimation for cross-linked peptides identified by mass spectrometry. NATURE METHODS, 9(9), 901-903. doi:10.1038/nmeth.2103.

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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Walzthoeni, Thomas1, Autor
Claassen, Manfred1, Autor
Leitner, Alexander1, Autor
Herzog, Franz1, Autor
Bohn, Stefan2, Autor           
Förster, Friedrich3, Autor           
Beck, Martin1, Autor
Aebersold, Ruedi1, Autor
Affiliations:
1external, ou_persistent22              
2Baumeister, Wolfgang / Molecular Structural Biology, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565142              
3Förster, Friedrich / Modeling of Protein Complexes, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565148              

Inhalt

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Schlagwörter: PROTEIN STRUCTURES; 26S PROTEASOME; LINKING; BIOINFORMATICS; ARCHITECTURE; COMPLEXES; STRATEGY
 Zusammenfassung: The mass spectrometric identification of chemically cross-linked peptides (CXMS) specifies spatial restraints of protein complexes; these values complement data obtained from common structure-determination techniques. Generic methods for determining false discovery rates of cross-linked peptide assignments are currently lacking, thus making data sets from CXMS studies inherently incomparable. Here we describe an automated target-decoy strategy and the software tool xProphet, which solve this problem for large multicomponent protein complexes.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2012-09
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: 3
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: ISI: 000308497800022
DOI: 10.1038/nmeth.2103
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: NATURE METHODS
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: MACMILLAN BUILDING, 4 CRINAN ST, LONDON N1 9XW, ENGLAND : NATURE PUBLISHING GROUP
Seiten: - Band / Heft: 9 (9) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 901 - 903 Identifikator: ISSN: 1548-7091