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  Photooxidative stress-induced and abundant small RNAs in Rhodobacter sphaeroides

Berghoff, B. A., Glaeser, J., Sharma, C. M., Vogel, J., & Klug, G. (2009). Photooxidative stress-induced and abundant small RNAs in Rhodobacter sphaeroides. Molecular Microbiology, 74(6), 1497-1512.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-C066-2 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-C067-F
資料種別: 学術論文

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:
Mol_Microbiol_2009_74_1497.pdf (出版社版), 624KB
 
ファイルのパーマリンク:
-
ファイル名:
Mol_Microbiol_2009_74_1497.pdf
説明:
-
OA-Status:
閲覧制限:
制限付き (Max Planck Institute for Infection Biology, MBIB; )
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
eDoc_access: INSTITUT
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Berghoff, Bork A., 著者
Glaeser, Jens, 著者
Sharma, Cynthia Mira1, 著者           
Vogel, Jörg1, 著者           
Klug, Gabriele, 著者
所属:
1Max-Planck Research Group RNA Biology, Max Planck Institute for Infection Biology, Max Planck Society, ou_1664150              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: P>Exposure to oxygen and light generates photooxidative stress by the bacteriochlorophyll a mediated formation of singlet oxygen (1O(2)) in Rhodobacter sphaeroides. Our study reports the genome-wide search for small RNAs (sRNAs) involved in the regulatory response to 1O(2). By using 454 pyrosequencing and Northern blot analysis, we identified 20 sRNAs from R. sphaeroides aerobic cultures or following treatment with 1O(2) or superoxide (O-(2)). One sRNA was specifically induced by 1O(2) and its expression depends on the extracytoplasmic function sigma factor RpoE. Two sRNAs induced by 1O(2) and O-(2) were cotranscribed with upstream genes preceded by promoters with target sequences for the alternative sigma factors RpoH(I) and RpoH(II). The most abundant sRNA was processed in the presence of 1O(2) but not by O-(2). From this and a second sRNA a conserved 3'-segment accumulated from a larger precursor. Absence of the RNA chaperone Hfq changed the half-lives, abundance and processing of 1O(2)-affected sRNAs. Orthologues of three sRNA genes are present in different alpha-proteobacteria, but the majority was unique to R. sphaeroides or Rhodobacterales species. Our discovery that abundant sRNAs are affected by 1O(2) exposure extends the knowledge on the role of sRNAs and Hfq in the regulatory response to oxidative stress.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2009-12
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 444206
ISI: 000272659700018
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Molecular Microbiology
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 74 (6) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1497 - 1512 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 0950-382X