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  Mapping of the second tetracycline binding site on the ribosomal small subunit of E.coli

Anokhina, M. M., Barta, A., Nierhaus, K. H., Spiridonova, V. A., & Kopylov, A. M. (2004). Mapping of the second tetracycline binding site on the ribosomal small subunit of E.coli. Nucleic Acids Research, 32(8), 2594-2597. doi:DOI: 10.1093/nar/gkh583.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : Nucleic Acids Res

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Anokhina, Maria M., Autor
Barta, Andrea, Autor
Nierhaus, Knud H.1, Autor           
Spiridonova, Vera A., Autor
Kopylov, Alexei M., Autor
Affiliations:
1Ribosomes, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433558              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Tetracycline blocks stable binding of aminoacyl-tRNA to the bacterial ribosomal A-site. Various tetracycline binding sites have been identified in crystals of the 30S ribosomal small subunit of Thermus thermophilus. Here we describe a direct photo- affinity modification of the ribosomal small subunits of Escherichia coli with 7-[3H]-tetracycline. To select for specific interactions, an excess of the 30S subunits over tetracycline has been used. Primer extension analysis of the 16S rRNA revealed two sites of the modifications: C936 and C948. Considering available data on tetracycline interactions with the prokaryotic 30S subunits, including the presented data (E.coli), X-ray data (T.thermophilus) and genetic data (Helicobacter pylori, E.coli), a second high affinity tetracycline binding site is proposed within the 3'-major domain of the 16S rRNA, in addition to the A-site related tetracycline binding site.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2004-05-11
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 224240
DOI: DOI: 10.1093/nar/gkh583
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nucleic Acids Research
  Alternativer Titel : Nucleic Acids Res
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 32 (8) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 2594 - 2597 Identifikator: ISSN: 0305-1048