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  Finding disease specific alterations in the co-expression of genes

Kostka, D., & Spang, R. (2004). Finding disease specific alterations in the co-expression of genes. Biioinformatics, 20, Suppl. 1, i194-i199.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-87FB-3 Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-87FC-1
Genre: Konferenzbeitrag

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Kostka, Dennis1, Autor
Spang, Rainer2, Autor           
Affiliations:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433547              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Motivation: Standard analysis routines for microarray data aim at differentially expressed genes. In this paper, we address the complementary problem of detecting sets of differentially co-expressed genes in two phenotypically distinct sets of expression profiles. Results: We introduce a score for differential co-expression and suggest a computationally efficient algorithm for finding high scoring sets of genes. The use of our novel method is demonstrated in the context of simulations and on real expression data from a clinical study.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2004-08-01
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 228575
DOI: 10.1093/bioinformatics/bth909
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Titel: Twelfth International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology/Third European Conference on Computational Biology
Veranstaltungsort: Glasgow, UK
Start-/Enddatum: 2004-07-21 - 2004-08-04

Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Biioinformatics
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 20, Suppl. 1 Artikelnummer: - Start- / Endseite: i194 - i199 Identifikator: ISSN: 1460-2059