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  SVC: structured visualization of evolutionary sequence conservation

Roepcke, S., Fiziev, P., Seeburg, P. H., & Vingron, M. (2005). SVC: structured visualization of evolutionary sequence conservation. Web Server Issue, W271-W273. Retrieved from 10.1093/nar/gki589.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : NAR

Dateien

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:
W271.pdf (beliebiger Volltext), 88KB
Name:
W271.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
eDoc_access: PUBLIC
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Roepcke, Stefen1, Autor
Fiziev, P., Autor
Seeburg, P. H., Autor
Vingron, Martin2, Autor           
Affiliations:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2Gene regulation (Martin Vingron), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479639              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: We have developed a web application for the detailed analysis and visualization of evolutionary sequence conservation in complex vertebrate genes. Given a pair of orthologous genes, the protein-coding sequences are aligned. When these sequences are mapped back onto their encoding exons in the genomes, a scaffold of the conserved gene structure naturally emerges. Sequence similarity between exons and introns is analysed and embedded into the gene structure scaffold. The visualization on the SVC server provides detailed information about evolutionarily conserved features of these genes. It further allows concise

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2005-04-29
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 268480
URI: 10.1093/nar/gki589
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Web Server Issue
Genre der Quelle: Heft
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: W271 - W273 Identifikator: -

Quelle 2

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Titel: Nucleic Acids Research
  Alternativer Titel : NAR
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 33 Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 0305-1048