Lethality and entropy of protein interaction networks

Manke, Thomas; Demetrius, Lloyd; Vingron, Martin

Lethality and entropy of protein interaction networks

Manke, T., Demetrius, L., & Vingron, M. (2005). Lethality and entropy of protein interaction networks. In R., Heinrich, C., DeLisi, M., Kanehisa, & a. S., Miyano (Eds.), Genome informatics series: proceedings of the.. Workshop on Genome Informatics. Workshop on Genome Informatics (pp. 159-163). Tokyo: Universal Academy Press.

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資料種別: 会議論文

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Manke, Thomas¹, 著者
Demetrius, Lloyd¹, 著者
Vingron, Martin², 著者

所属:
1Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433547
2Gene regulation (Martin Vingron), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479639

内容説明

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キーワード: -

要旨: We characterize protein interaction networks in terms of network entropy. This approach suggests a ranking principle, which strongly correlates with elements of functional importance, such as lethal proteins. Our combined analysis of protein interaction networks and functional profiles in single cellular yeast and multi-cellular worm shows that proteins with large contribution to network entropy are preferentially lethal. While entropy is inherently a dynamical concept, the present analysis incorporates only structural information. Our result therefore highlights the importance of topological features, which appear as correlates of an underlying dynamical property, and which in turn determine functional traits. We argue that network entropy is a natural extension of previously studied observables, such as pathway multiplicity and centrality. It is also applicable to networks in which the processes can be quantified and therefore serves as a link to study questions of structural and dynamical robustness in a unified way.

資料詳細

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言語: eng - English

日付: 出版: 2005-08-01

出版の状態: 出版

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識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 265337

学位: -

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出版物 1

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出版物名: Genome informatics series : proceedings of the ... Workshop on Genome Informatics. Workshop on Genome Informatics

種別: 会議論文集

著者・編者:
Heinrich, R., 編集者
DeLisi, C., 編集者
Kanehisa, M., 編集者
Miyano, and S., 編集者

所属:
-

出版社, 出版地: Tokyo : Universal Academy Press

ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 159 - 163 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -

出版物 2

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出版物名: Genome Informatics 2005

種別: 連載記事

著者・編者:

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出版社, 出版地: -

ページ: - 巻号: 16 (1) 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 0919-9454

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