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  Whole genome analysis of the marine Bacteroidetes 'Gramella forsetii' reveals adaptations to degradation of polymeric organic matter

Bauer, M., Kube, M., Teeling, H., Richter, M., Lombardot, T., Allers, E., Wuerdemann, C. A., Quast, C., Kuhl, H., Knaus, F., Woebken, D., Kerstin Bischof, K., Mussmann, M., Choudhur, J. V., Meyer, F., Reinhardt, R., Amann, R. I., & Gloeckner, F. O. (2006). Whole genome analysis of the marine Bacteroidetes 'Gramella forsetii' reveals adaptations to degradation of polymeric organic matter. Environmental Microbiology, 8(12), 2201-2213. doi:10.1111/j.1462-2920.2006.01152.x.

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基本情報

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Environ Microbiol

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j.1462-2920.2006.01152.pdf (全文テキスト(全般)), 381KB
 
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j.1462-2920.2006.01152.pdf
説明:
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制限付き (Max Planck Institute for Molecular Genetics, MBMG; )
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf
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著作権日付:
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著作権情報:
eDoc_access: INSTITUT
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Bauer, Margarete1, 著者
Kube, Michael2, 著者           
Teeling, Hanno2, 著者           
Richter,, Michael1, 著者
Lombardot, Thierry1, 著者
Allers, Elke1, 著者
Wuerdemann, Chris A.1, 著者
Quast, Christina1, 著者
Kuhl, Heiner3, 著者           
Knaus, Florian1, 著者
Woebken, Dagmar1, 著者
Kerstin Bischof, Kerstin1, 著者
Mussmann, Marc1, 著者
Choudhur, Jomuna V., 著者
Meyer, Folker, 著者
Reinhardt, Richard2, 著者           
Amann, Rudolf I.1, 著者
Gloeckner, Frank Oliver1, 著者
所属:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2High Throughput Technologies, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433552              
3Sequencing (Head: Bernd Timmermann), Scientific Service (Head: Manuela B. Urban), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479670              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Members of the Bacteroidetes, formerly known as the Cytophaga-Flavobacteria-Bacteroides (CFB) phylum, are among the major taxa of marine heterotrophic bacterioplankton frequently found on macroscopic organic matter particles (marine snow). In addition, they have been shown to also represent a significant part of free-living microbial assemblages in nutrient-rich microenvironments. Their abundance and distribution pattern in combination with enzymatic activity studies has led to the notion that organisms of this group are specialists for degradation of high molecular weight compounds in both the dissolved and particulate fraction of the marine organic matter pool, implying a major role of Bacteroidetes in the marine carbon cycle. Despite their ecological importance, comprehensive molecular data on organisms of this group have been scarce so far. Here we report on the first whole genome analysis of a marine Bacteroidetes representative, 'Gramella forsetii' KT0803. Functional analysis of the predicted proteome disclosed several traits which in joint consideration suggest a clear adaptation of this marine Bacteroidetes representative to the degradation of high molecular weight organic matter, such as a substantial suite of genes encoding hydrolytic enzymes, a predicted preference for polymeric carbon sources and a distinct capability for surface adhesion.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2006-12-01
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 301521
DOI: 10.1111/j.1462-2920.2006.01152.x
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Environmental Microbiology
  出版物の別名 : Environ Microbiol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 8 (12) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2201 - 2213 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1462-2912