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  In vitro selection of random RNA fragments to identify protein-binding sites within large RNAs

Stelz, U., & Nierhaus, K. (2008). In vitro selection of random RNA fragments to identify protein-binding sites within large RNAs. In R.-J. Lin (Ed.), RNA-Protein Interaction Protocols (pp. 247-255). Berlin [et al]: Springer.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7EED-A Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7EEE-8
Genre: Buchkapitel

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10.1007_978-1-60327-475-3@17.pdf (beliebiger Volltext), 443KB
 
Datei-Permalink:
-
Name:
10.1007_978-1-60327-475-3@17.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Eingeschränkt (Max Planck Institute for Molecular Genetics, MBMG; )
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
eDoc_access: MPG
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Stelz, Ulrich1, Autor
Nierhaus, Knud2, Autor           
Affiliations:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2Ribosomes, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433558              

Inhalt

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Schlagwörter: In vitro selection - ribosome - RNA binding site - RNA-protein interaction - SELEX - SERF
 Zusammenfassung: In vitro selection experiments have various goals depending on the composition of the initial pool and the selection method applied. We developed an in vitro selection variant that is useful for the identification of minimal RNA binding sites for proteins within large RNAs. A pool of randomly fragmented RNA is constructed from a large RNA, which is the natural binding partner for a protein. Such a pool contains all the potential binding sites and is therefore used as starting material for affinity selection. A successful in vitro selection with the purified protein will identify the protein's natural RNA target site. The method has been developed for ribosomal systems and is a general approach providing a basis for the functional and structural characterization of large ribonucleoprotein particles.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2008-10-01
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 412542
URI: http://www.springerprotocols.com/Abstract/doi/10.1007/978-1-60327-475-3_17
DOI: 10.1007/978-1-60327-475-3_17
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: RNA-Protein Interaction Protocols
Genre der Quelle: Buch
 Urheber:
Lin, Ren-Jang, Herausgeber
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: Berlin [et al] : Springer
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: 247 - 255 Identifikator: ISBN: 978-1-58829-419-7

Quelle 2

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Titel: Methods in Molecular Biology
Genre der Quelle: Reihe
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 488 Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: -