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  New clustering module in BDPC bisulfite sequencing data presentation and compilation web application for DNA methylation analyses.

Rohde, C., Zhang, Y., Stamerjohanns, H., Hecher, K., Reinhardt, R., & Jeltsch, A. (2009). New clustering module in BDPC bisulfite sequencing data presentation and compilation web application for DNA methylation analyses. BioTechniques, 47(3), 781-783. doi:10.2144/000113196.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7D1A-0 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7D1B-E
資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Biotechniques

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:
781.pdf (全文テキスト（全般）), 2MB
 
ファイルのパーマリンク:
-
ファイル名:
781.pdf
説明:
-
OA-Status:
閲覧制限:
制限付き (Max Planck Institute for Molecular Genetics, MBMG; )
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
eDoc_access: INSTITUT
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Rohde, Christian, 著者
Zhang, Yingying, 著者
Stamerjohanns, Heinrich, 著者
Hecher, Kurt, 著者
Reinhardt, Richard1, 著者           
Jeltsch, Albert, 著者
所属:
1High Throughput Technologies, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433552              

内容説明

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キーワード: DNA methylation; epigenetics; bisulfite analysis; methylome; epigenome; BiQ Analyzer
 要旨: The Bisulfite Sequencing Data Presentation and Compilation (BDPC) web interface for compilation and presentation of data from bisulfite sequencing DNA methylation studies has been improved by adding a new module. This module allows visualization of the whole data set in form of a heatmap of DNA methylation levels and clustering and comparison of tissue methylation patterns. It can also be used for data not processed by BDPC. In addition, several functions of the existing BDPC compilation module have been improved.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2009-09-01
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 461005
URI: http://www.biotechniques.com/BiotechniquesJournal/2009/September/New-clustering-module-in-BDPC-bisulfite-sequencing-data-presentation-and-compilation-web-application-for-DNA-methylation-analyses/biotechniques-173804.html
DOI: 10.2144/000113196
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: BioTechniques
  出版物の別名 : Biotechniques
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 47 (3) 通巻号: - 開始・終了ページ: 781 - 783 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 0736-6205