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  TransFind--predicting transcriptional regulators for gene sets

Kielbasa, S. M., Klein, H., Roider, H. G., Vingron, M., & Blüthgen, N. (2010). TransFind--predicting transcriptional regulators for gene sets. Nucleic Acids Research, 38 Suppl, W275-W280. doi:doi:10.1093/nar/gkq438.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : Nucleic Acids Res

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Kielbasa.pdf (beliebiger Volltext), 244KB
Name:
Kielbasa.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
eDoc_access: PUBLIC
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Kielbasa, S. M.1, Autor           
Klein, H., Autor
Roider, H. G.1, Autor           
Vingron, M.2, Autor           
Blüthgen, N., Autor
Affiliations:
1Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433547              
2Gene regulation (Martin Vingron), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479639              

Inhalt

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Schlagwörter: Binding Sites; Gene Expression Regulation; Internet; Phylogeny; Promoter Regions, Genetic; Software; Transcription Factors/metabolism; Transcription, Genetic
 Zusammenfassung: The analysis of putative transcription factor binding sites in promoter regions of coregulated genes allows to infer the transcription factors that underlie observed changes in gene expression. While such analyses constitute a central component of the in-silico characterization of transcriptional regulatory networks, there is still a lack of simple-to-use web servers able to combine state-of-the-art prediction methods with phylogenetic analysis and appropriate multiple testing corrected statistics, which returns the results within a short time. Having these aims in mind we developed TransFind, which is freely available at http://transfind.sys-bio.net/.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2010-07-01
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 538375
DOI: doi:10.1093/nar/gkq438
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nucleic Acids Research
  Alternativer Titel : Nucleic Acids Res
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 38 Suppl Artikelnummer: - Start- / Endseite: W275 - W280 Identifikator: ISSN: 1362-4962 (Electronic)