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  The bicoid mRNA localization factor Exuperantia is an RNA-binding pseudonuclease.

Lazzaretti, D., Veith, K., Kramer, K., Basquin, C., Urlaub, H., Iron, U., et al. (2016). The bicoid mRNA localization factor Exuperantia is an RNA-binding pseudonuclease. Nature Structural and Molecular Biology, 23(8), 705-713. doi:10.1038/nsmb.3254.

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002B-2F22-C Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002C-DE4D-F
Genre: Zeitschriftenartikel

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Externe Referenzen

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externe Referenz:
http://www.nature.com/nsmb/journal/v23/n8/full/nsmb.3254.html (Verlagsversion)
Beschreibung:
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Urheber

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 Urheber:
Lazzaretti, D., Autor
Veith, K., Autor
Kramer, K.1, Autor           
Basquin, C., Autor
Urlaub, H.1, Autor           
Iron, U., Autor
Bono, F., Autor
Affiliations:
1Research Group of Bioanalytical Mass Spectrometry, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_578613              

Inhalt

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Schlagwörter: Developmental biology; RNA; RNA-binding proteins; X-ray crystallography
 Zusammenfassung: Anterior patterning in Drosophila is mediated by the localization of bicoid (bcd) mRNA at the anterior pole of the oocyte. Exuperantia (Exu) is a putative exonuclease (EXO) associated with bcd and required for its localization. We present the crystal structure of Exu, which reveals a dimeric assembly with each monomer consisting of a 3′-5′ EXO-like domain and a sterile alpha motif (SAM)-like domain. The catalytic site is degenerate and inactive. Instead, the EXO-like domain mediates dimerization and RNA binding. We show that Exu binds RNA directly in vitro, that the SAM-like domain is required for RNA binding activity and that Exu binds a structured element present in the bcd 3′ untranslated region with high affinity. Through structure-guided mutagenesis, we show that Exu dimerization is essential for bcd localization. Our data demonstrate that Exu is a noncanonical RNA-binding protein with EXO-SAM-like domain architecture that interacts with its target RNA as a homodimer.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2016-07-042016-08
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1038/nsmb.3254
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nature Structural and Molecular Biology
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 23 (8) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 705 - 713 Identifikator: -