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  Advantages and Pitfalls of Mass Spectrometry Based Metabolome Profiling in Systems Biology

Aretz, I., & Meierhofer, D. (2016). Advantages and Pitfalls of Mass Spectrometry Based Metabolome Profiling in Systems Biology. International Journal of Molecular Sciences, 17(5):. doi:10.3390/ijms17050632.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Aretz.pdf (出版社版), 230KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002B-16D9-4
ファイル名:
Aretz.pdf
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application/pdf / [MD5]
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著作権日付:
-
著作権情報:
© 2016 by the authors; licensee MDPI, Basel, Switzerland

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作成者

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 作成者:
Aretz, Ina1, 著者           
Meierhofer, David1, 著者           
所属:
1Mass Spectrometry (Head: David Meierhofer), Scientific Service (Head: Christoph Krukenkamp), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479669              

内容説明

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キーワード: metabolome profiling; mass spectrometry; nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy; systems biology; multiple reaction monitoring (MRM); LC-MS; derivatization
 要旨: Mass spectrometry-based metabolome profiling became the method of choice in systems biology approaches and aims to enhance biological understanding of complex biological systems. Genomics, transcriptomics, and proteomics are well established technologies and are commonly used by many scientists. In comparison, metabolomics is an emerging field and has not reached such high-throughput, routine and coverage than other omics technologies. Nevertheless, substantial improvements were achieved during the last years. Integrated data derived from multi-omics approaches will provide a deeper understanding of entire biological systems. Metabolome profiling is mainly hampered by its diversity, variation of metabolite concentration by several orders of magnitude and biological data interpretation. Thus, multiple approaches are required to cover most of the metabolites. No software tool is capable of comprehensively translating all the data into a biologically meaningful context yet. In this review, we discuss the advantages of metabolome profiling and main obstacles limiting progress in systems biology.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2016-04-27
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.3390/ijms17050632
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: International Journal of Molecular Sciences
  省略形 : Int. J. Mol. Sci.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Basel, Switzerland : MDPI AG
ページ: - 巻号: 17 (5) 通巻号: pii: E632 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1422-0067
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1422-0067