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  The circular SiZer, inferred persistence of shape parameters and application to early stem cell differentiation.

Huckemann, S., Kim, K. R., Munk, A., Rehfeld, F., Sommerfeld, M., Weickert, J., & Wollnik, C. (2016). The circular SiZer, inferred persistence of shape parameters and application to early stem cell differentiation. Bernoulli, 22(4), 2113-2142. doi:10.3150/15-BEJ722.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Huckemann, S., 著者
Kim, K. R., 著者
Munk, A.1, 著者           
Rehfeld, F., 著者
Sommerfeld , M., 著者
Weickert, J., 著者
Wollnik, C., 著者
所属:
1Research Group of Statistical Inverse-Problems in Biophysics, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_1113580              

内容説明

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キーワード: circular data; circular scale spaces; mode hunting; multiscale process; persistence inference; stem cell differentiation; variation diminishing; wrapped Gaussian kernel estimator
 要旨: We generalize the SiZer of Chaudhuri and Marron (J. Amer. Statist. Assoc. 94 (1999) 807-823; Ann. Statist. 28 (2000) 408-428) for the detection of shape parameters of densities on the real line to the case of circular data. It turns out that only the wrapped Gaussian kernel gives a symmetric, strongly Lipschitz semi-group satisfying "circular" causality, that is, not introducing possibly artificial modes with increasing levels of smoothing. Some notable differences between Euclidean and circular scale space theory are highlighted. Based on this, we provide an asymptotic theory to make inference about the persistence of shape features. The resulting circular mode persistence diagram is applied to the analysis of early mechanically-induced differentiation in adult human stem cells from their actin-myosin filament structure. As a consequence, the circular SiZer based on the wrapped Gaussian kernel (WiZer) allows the verification at a controlled error level of the observation reported by Zemel et al. (Nat. Phys. 6 (2010) 468-473): Within early stem cell differentiation, polarizations of stem cells exhibit preferred directions in three different micro-environments.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2016-05-032016-11
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.3150/15-BEJ722
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Bernoulli
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 22 (4) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2113 - 2142 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -