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  Translational regulation shapes the molecular landscape of complex disease phenotypes

Schafer, S., Adami, E., Heinig, M., Rodrigues, K. E., Kreuchwig, F., Silhavy, J., van Heesch, S., Simaite, D., Rajewsky, N., Cuppen, E., Pravenec, M., Vingron, M., Cook, S. A., & Hubner, N. (2015). Translational regulation shapes the molecular landscape of complex disease phenotypes. Nat Commun, 6:. doi:10.1038/ncomms8200.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Schafer.pdf (出版社版), 858KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002A-3945-9
ファイル名:
Schafer.pdf
説明:
-
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
© 2015 Macmillan Publishers Limited

関連URL

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URL:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26007203 (全文テキスト(全般))
説明:
-
OA-Status:

作成者

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 作成者:
Schafer, S., 著者
Adami, E., 著者
Heinig, M.1, 著者           
Rodrigues, K. E., 著者
Kreuchwig, F., 著者
Silhavy, J., 著者
van Heesch, S., 著者
Simaite, D., 著者
Rajewsky, N., 著者
Cuppen, E., 著者
Pravenec, M., 著者
Vingron, M.2, 著者           
Cook, S. A., 著者
Hubner, N., 著者
所属:
1Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433547              
2Gene regulation (Martin Vingron), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479639              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The extent of translational control of gene expression in mammalian tissues remains largely unknown. Here we perform genome-wide RNA sequencing and ribosome profiling in heart and liver tissues to investigate strain-specific translational regulation in the spontaneously hypertensive rat (SHR/Ola). For the most part, transcriptional variation is equally apparent at the translational level and there is limited evidence of translational buffering. Remarkably, we observe hundreds of strain-specific differences in translation, almost doubling the number of differentially expressed genes. The integration of genetic, transcriptional and translational data sets reveals distinct signatures in 3'UTR variation, RNA-binding protein motifs and miRNA expression associated with translational regulation of gene expression. We show that a large number of genes associated with heart and liver traits in human genome-wide association studies are primarily translationally regulated. Capturing interindividual differences in the translated genome will lead to new insights into the genes and regulatory pathways underlying disease phenotypes.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2015-05-26
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/ncomms8200
ISSN: 2041-1723 (Electronic)
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Nat Commun
  出版物の別名 : Nature communications
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 6 通巻号: 6:7200 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -