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  Glutamine rotamers in BLUF photoreceptors: a mechanistic reappraisal

Udvarhelyi, A., & Domratcheva, T. (2013). Glutamine rotamers in BLUF photoreceptors: a mechanistic reappraisal. Journal of Physical Chemistry B, 117(10), 2888-2897. doi:10.1021/jp400437x.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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JPhysChemB_117_2013_2888.pdf (全文テキスト(全般)), 2MB
 
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JPhysChemB_117_2013_2888.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Medical Research, MHMF; )
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application/pdf
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http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jp400437x (全文テキスト(全般))
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http://dx.doi.org/10.1021/jp400437x (全文テキスト(全般))
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作成者

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 作成者:
Udvarhelyi, Anikó1, 著者           
Domratcheva, Tatiana1, 著者           
所属:
1Department of Biomolecular Mechanisms, Max Planck Institute for Medical Research, Max Planck Society, ou_1497700              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The blue light using FAD (BLUF) photosensory protein domain is activated by a unique photoreaction that results in a hydrogen-bond rearrangement around the flavin chromophore. The chemical structure of the hydrogen bond switch is a long-standing debate: The two main hypotheses postulate rotation as opposed to tautomerization of a conserved glutamine residue. Attempts to resolve the debate were inconclusive so far, despite numerous experimental and computational studies. Here we propose physical criteria for the dark and light state structures as well as for the light-activation process to evaluate existing models of BLUF using quantum-chemical calculations. The glutamine rotamer assignment of the crystal structure with the pdb code 1YRX does not satisfy our criteria because after equilibrating the intermolecular forces the glutamine rotamer in 1YRX is incompatible with the experimental density. We identified the root of the mechanistic controversy in the incorrect glutamine rotamer assignment of 1YRX . Furthermore, we show that the glutamine side chain may rotate without light activation in the BLUF dark state. Finally, we demonstrate that the tautomerized glutamine is consistent with our criteria and observations of the BLUF light state

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2013-01-142013-02-192013-02-192013-03-14
 出版の状態: 出版
 ページ: 10
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1021/jp400437x
その他: 7893
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Journal of Physical Chemistry B
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 117 (10) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2888 - 2897 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1520-6106
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1000000000293370