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  Electron density deformations provide new insights into the spectral shift of rhodopsins

Hernández-Rodríguez, E. W., Montero-Alejo, A. L., López, R., Sánchez-García, E., Montero-Cabrera, L. A., & García de la Vega, J. (2013). Electron density deformations provide new insights into the spectral shift of rhodopsins. Journal of Computational Chemistry, 34(28), 2460-2471. doi:10.1002/jcc.23414.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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jcc23414-sup-0001-suppinfo.pdf (付録資料), 4MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-A2CB-F
ファイル名:
jcc23414-sup-0001-suppinfo.pdf
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application/pdf / [MD5]
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作成者

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 作成者:
Hernández-Rodríguez, Erix Wiliam1, 2, 3, 著者
Montero-Alejo, Ana Lilian3, 著者
López, Rafael2, 著者
Sánchez-García, Elsa4, 著者           
Montero-Cabrera, Luis Alberto3, 著者
García de la Vega, José 2, 著者
所属:
1Departamento de Bioquíımica, Instituto de Ciencias Básicas y Preclínicas“Victoria de Girón,” Universidad de Ciencias Médicas de La Habana, Havana 11600, Cuba, ou_persistent22              
2Departamento de Química Física Aplicada, Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma de Madrid, Madrid 28049, Spain, ou_persistent22              
3Laboratorio de Química Computacional y Teórica, Departamento de Química Física, Universidad de La Habana, Havana 10400, Cuba, ou_persistent22              
4Research Group Sánchez-García, Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Max Planck Society, Kaiser-Wilhelm-Platz 1, 45470 Mülheim an der Ruhr, DE, ou_1950289              

内容説明

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キーワード: rhodopsin; mutations; retinitis pigmentosa; electronic structure; electron density deformations
 要旨: Spectral shifts of rhodopsin, which are related to variations of the electron distribution in 11-cis-retinal, are investigated here using the method of deformed atoms in molecules. We found that systems carrying the M207R and S186W mutations display large perturbations of the π-conjugated system with respect to wild-type rhodopsins. These changes agree with the predicted behavior of the bond length alternation (BLA) and the blue shifts of vertical excitation energies of these systems. The effect of the planarity of the central and Schiff-base regions of retinal chain on the electronic structure of the chromophore is also investigated. By establishing nonlinear polynomial relations between BLA, chain distortions, and vertical excitation energies, we are also able to provide a semiquantitative approach for the understanding of the mechanisms regulating spectral shifts in rhodopsin and its mutants.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2013-07-262013-06-042013-07-272013-08-262013-10-30
 出版の状態: 出版
 ページ: 12
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1002/jcc.23414
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Journal of Computational Chemistry
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York : Wiley
ページ: 12 巻号: 34 (28) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2460 - 2471 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0192-8651
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925489848