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  A large pseudoautosomal region on the sex chromosomes of the frog Silurana tropicalis

Bewick, A. J., Chain, F. J. J., Zimmerman, L. B., Sesay, A., Gilchrist, M. J., Owens, N. D., Seifertova, E., Krylov, V., Macha, J., Tlapakova, T., Kubickova, S., Cernohorska, H., Zarsky, V., & Evans, B. J. (2013). A large pseudoautosomal region on the sex chromosomes of the frog Silurana tropicalis. Genome biology and evolution, 5(6), 1087-1098. doi:10.1093/gbe/evt073.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Bewick_2013.pdf (出版社版), 440KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-6CDF-4
ファイル名:
Bewick_2013.pdf
説明:
-
OA-Status:
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公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Bewick, Adam J., 著者
Chain, Frédéric J. J.1, 著者           
Zimmerman, Lyle B., 著者
Sesay, Abdul, 著者
Gilchrist, Michael J., 著者
Owens, Nick D.L., 著者
Seifertova, Eva, 著者
Krylov, Vladimir, 著者
Macha, Jaroslav, 著者
Tlapakova, Tereza, 著者
Kubickova, Svatava, 著者
Cernohorska, Halina, 著者
Zarsky, Vojtech, 著者
Evans, Ben J., 著者
所属:
1Department Evolutionary Ecology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_1445634              

内容説明

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キーワード: sex chromosome; pseudoautosomal region; recombination; sex determination; African clawed frogs; Xenopus tropicalis
 要旨: Sex chromosome divergence has been documented across phylogenetically diverse species, with amphibians typically having cytologically nondiverged (“homomorphic”) sex chromosomes. With an aim of further characterizing sex chromosome divergence of an amphibian, we used “RAD-tags” and Sanger sequencing to examine sex specificity and heterozygosity in theWestern clawed frog Silurana tropicalis (also known as Xenopus tropicalis). Our findings based on approximately 20 million genotype calls and approximately 200 polymerase chain reaction-amplified regions across multiple male and female genomes failed to identify a substantially sized genomic region with genotypic hallmarks of sex chromosome divergence, including in regions known to be tightly linked to the sex-determining region.Wealso foundthat expression andmolecular evolutionof genes linked to the sex-determining region did not differ substantially from genes in other parts of the genome. This suggests that the pseudoautosomal region, where recombination occurs, comprises a large portion of the sex chromosomes of S. tropicalis. These resultsmay in part explainwhy African clawed frogs have such a high incidence of polyploidization, shed light onwhy amphibians have a high rate of sex chromosome turnover, and raise questions about why homomorphic sex chromosomes are so prevalent in amphibians.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2013-05-032013-05-09
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1093/gbe/evt073
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Genome biology and evolution
  その他 : GBE
  省略形 : Genome Biol Evol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Oxford : Oxford Univ. Press
ページ: - 巻号: 5 (6) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1087 - 1098 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): その他: 1759-6653
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1759-6653