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  The metabolic signature related to high plant growth rate in Arabidopsis thaliana

Meyer, R. C., Steinfath, M., Lisec, J., Becher, M., Witucka-Wall, H., Torjek, O., Fiehn, O., Eckardt, A., Willmitzer, L., Selbig, J., & Altmann, T. (2007). The metabolic signature related to high plant growth rate in Arabidopsis thaliana. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 104(11), 4759-4764. doi:10.1073/pnas.0609709104.

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-28C5-2 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-28C6-F
資料種別: 学術論文

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Meyer-2007-The metabolic signat.pdf (全文テキスト（全般）), 2MB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-28C7-D
ファイル名:
Meyer-2007-The metabolic signat.pdf
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
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-
著作権情報:
-
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-

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作成者

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 作成者:
Meyer, R. C.1, 著者           
Steinfath, M.2, 著者           
Lisec, J.3, 著者           
Becher, M.4, 著者           
Witucka-Wall, H.5, 著者
Torjek, O.1, 著者           
Fiehn, O.6, 著者           
Eckardt, A.3, 著者           
Willmitzer, L.3, 著者           
Selbig, J.2, 著者           
Altmann, T.1, 著者           
所属:
1Developmental Physiology and Genomics, Cooperative Research Groups, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753313              
2BioinformaticsCRG, Cooperative Research Groups, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753315              
3Small Molecules, Department Willmitzer, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753340              
4Metal Homeostasis, Cooperative Research Groups, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753309              
5External Organizations, ou_persistent22              
6Metabolomic Analysis, Department Willmitzer, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753345              

内容説明

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キーワード: biomass canonical correlation metabolic profiling recombinant inbred line population biomarker trehalose 6-phosphate ascorbic-acid classification lines
 要旨: The decline of available fossil fuel reserves has triggered worldwide efforts to develop alternative energy sources based on plant biomass. Detailed knowledge of the relations of metabolism and biomass accumulation can be expected to yield powerful novel tools to accelerate and enhance energy plant breeding programs. We used metabolic profiling in the model Arabidopsis to study the relation between biomass and metabolic composition using a recombinant inbred line (RIL) population. A highly significant canonical correlation (0.73) was observed, revealing a close link between biomass and a specific combination of metabolites. Dividing the entire data set into training and test sets resulted in a median correlation between predicted and true biomass of 0.58. The demonstrated high predictive power of metabolic composition for biomass features this composite measure as an excellent biomarker and opens new opportunities to enhance plant breeding specifically in the context of renewable resources.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2007-03-162007
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: ISI: ISI:000244972700091
DOI: 10.1073/pnas.0609709104
ISSN: 0027-8424 (Print) 0027-8424 (Linking)
URI: ://000244972700091 http://www.pnas.org/content/104/11/4759.full.pdf
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 104 (11) 通巻号: - 開始・終了ページ: 4759 - 4764 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -