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  A "Crossomics" Study Analysing Variability of Different Components in Peripheral Blood of Healthy Caucasoid Individuals

Gruden, K., Hren, M., Herman, A., Blejec, A., Albrecht, T., Selbig, J., Bauer, C., Schuchardt, J., Or-Guil, M., Zupancic, K., Svajger, U., Stabuc, B., Ihan, A., Kopitar, A. N., Ravnikar, M., Knezevic, M., Rozman, P., & Jeras, M. (2012). A "Crossomics" Study Analysing Variability of Different Components in Peripheral Blood of Healthy Caucasoid Individuals. PLoS One, 7(1), e28761. doi:10.1371/journal.pone.0028761.

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資料種別: 学術論文

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Gruden-2012-A _Crossomics_ Study.pdf (全文テキスト(全般)), 558KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-1FB2-2
ファイル名:
Gruden-2012-A _Crossomics_ Study.pdf
説明:
-
OA-Status:
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Gruden, K.1, 著者
Hren, M.1, 著者
Herman, A.1, 著者
Blejec, A.1, 著者
Albrecht, T.1, 著者
Selbig, J.2, 著者           
Bauer, C.1, 著者
Schuchardt, J.1, 著者
Or-Guil, M.1, 著者
Zupancic, K.1, 著者
Svajger, U.1, 著者
Stabuc, B.1, 著者
Ihan, A.1, 著者
Kopitar, A. N.1, 著者
Ravnikar, M.1, 著者
Knezevic, M.1, 著者
Rozman, P.1, 著者
Jeras, M.1, 著者
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              
2BioinformaticsCRG, Cooperative Research Groups, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753315              

内容説明

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キーワード: messenger-rna expression gene-expression whole-blood reveals differences autoimmune-disease immune-system cells serum profiles cytokine
 要旨: Background: Different immunotherapy approaches for the treatment of cancer and autoimmune diseases are being developed and tested in clinical studies worldwide. Their resulting complex experimental data should be properly evaluated, therefore reliable normal healthy control baseline values are indispensable. Methodology/Principal Findings: To assess intra- and inter-individual variability of various biomarkers, peripheral blood of 16 age and gender equilibrated healthy volunteers was sampled on 3 different days within a period of one month. Complex "crossomics'' analyses of plasma metabolite profiles, antibody concentrations and lymphocyte subset counts as well as whole genome expression profiling in CD4(+)T and NK cells were performed. Some of the observed age, gender and BMI dependences are in agreement with the existing knowledge, like negative correlation between sex hormone levels and age or BMI related increase in lipids and soluble sugars. Thus we can assume that the distribution of all 39.743 analysed markers is well representing the normal Caucasoid population. All lymphocyte subsets, 20% of metabolites and less than 10% of genes, were identified as highly variable in our dataset. Conclusions/Significance: Our study shows that the intra- individual variability was at least two-fold lower compared to the inter-individual one at all investigated levels, showing the importance of personalised medicine approach from yet another perspective.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): ISI: ISI:000301357100004
DOI: 10.1371/journal.pone.0028761
ISSN: 1932-6203
URI: ://000301357100004 http://www.plosone.org/article/fetchObjectAttachment.action?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0028761&representation=PDF
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: PLoS One
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 7 (1) 通巻号: - 開始・終了ページ: e28761 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -