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  Microarrays: How Many Do You Need?

Zien, A., Fluck J, Zimmer, R., & Lengauer, T. (2002). Microarrays: How Many Do You Need? Proceedings of the Sixth Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2002), 321-330.

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基本情報

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資料種別: 会議論文

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作成者

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 作成者:
Zien, A1, 著者           
Fluck J, Zimmer, R, 著者
Lengauer, T, 著者
所属:
1Department Empirical Inference, Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Max Planck Society, ou_1497795              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: We estimate the number of microarrays that is required in order to gain reliable results from a common type of study: the pairwise comparison of different classes of samples. Current knowlegde seems to suffice for the construction of models that are realistic with respect to searches for individual differentially expressed genes. Such models allow to investigate the dependence of the required number of samples on the relevant parameters: the biological variability of the samples within each class; the fold changes in expression; the detection sensitivity of the microarrays; and the acceptable error rates of the results. We supply experimentalists with general conclusions as well as a freely accessible Java applet at http://cartan.gmd.de/~zien/classsize/ for fine tuning simulations to their particular actualities. Since the situation can be assumed to be very similar for large scale proteomics and metabolomics studies, our methods and results might also apply there.

資料詳細

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言語:
 日付: 2002-04
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): URI: http://www.scai.fhg.de/special/bio/howmanyarrays/
DOI: 10.1145/565196.565239
BibTex参照ID: 2144
 学位: -

関連イベント

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イベント名: Sixth Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology
開催地: Washington, DC, USA
開始日・終了日: -

訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Proceedings of the Sixth Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2002)
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY, USA : ACM Press
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 321 - 330 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -