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  A simple strand-specific RNA-Seq library preparation protocol combining the Illumina TruSeq RNA and the dUTP methods

Sultan, M., Dokel, S., Amstislavskiy, V., Wuttig, D., Sultmann, H., Lehrach, H., & Yaspo, M. L. (2012). A simple strand-specific RNA-Seq library preparation protocol combining the Illumina TruSeq RNA and the dUTP methods. Biochemical and Biophysical Research Communications, 422(4), 643-646. doi:10.1016/j.bbrc.2012.05.043.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Sultan.pdf (出版社版), 643KB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-F55C-A
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Sultan.pdf
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application/pdf / [MD5]
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著作権日付:
-
著作権情報:
© 2012 Elsevier Inc.
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Sultan, M.1, 著者           
Dokel, S., 著者
Amstislavskiy, V., 著者
Wuttig, D., 著者
Sultmann, H., 著者
Lehrach, H.2, 著者           
Yaspo, M. L.1, 著者           
所属:
1Human Chromosome 21 (Marie-Laure Yaspo), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479652              
2Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433550              

内容説明

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キーワード: Deoxyuracil Nucleotides/*chemistry/genetics Gene Expression Profiling/*methods *Gene Library Humans Sequence Analysis, RNA/*methods Transcriptome
 要旨: Preserving the original RNA orientation information in RNA-Sequencing (RNA-Seq) experiment is essential to the analysis and understanding of the complexity of mammalian transcriptomes. We describe herein a simple, robust, and time-effective protocol for generating strand-specific RNA-seq libraries suited for the Illumina sequencing platform. We modified the Illumina TruSeq RNA sample preparation by implementing the strand specificity feature using the dUTP method. This protocol uses low amounts of starting material and allows a fast processing within two days. It can be easily implemented and requires only few additional reagents to the original Illumina kit.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012-05-152012-06-15
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.05.043
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Biochemical and Biophysical Research Communications
  その他 : Biochem. Biophys. Res. Commun.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Orlando, Fla. : Academic Press
ページ: - 巻号: 422 (4) 通巻号: - 開始・終了ページ: 643 - 646 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0006-291X
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954922652205_1