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  A stringent yeast two-hybrid matrix screening approach for protein-protein interaction discovery

Worseck, J., Grossmann, A., Weimann, M., Hegele, A. K., & Stelzl, U. (2012). A stringent yeast two-hybrid matrix screening approach for protein-protein interaction discovery. Methods in Molecular Biology, 812, 63-87. doi:10.1007/978-1-61779-455-1_4.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Worseck.pdf (出版社版), 564KB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-EC0B-9
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Worseck.pdf
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application/pdf / [MD5]
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作成者

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 作成者:
Worseck, Josephine1, 著者           
Grossmann, Arndt2, 著者           
Weimann, Mareike1, 著者           
Hegele, Anna K.1, 著者           
Stelzl, Ulrich2, 著者           
所属:
1Independent Junior Research Groups (OWL), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, Berlin, Germany, ou_1433554              
2Molecular Interaction Networks (Ulrich Stelzl), Independent Junior Research Groups (OWL), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, Berlin, Germany, ou_1479660              

内容説明

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キーワード: Escherichia coli/genetics Proteins/*analysis/*metabolism Transformation, Bacterial *Two-Hybrid System Techniques Yeasts/genetics/growth & development beta-Galactosidase/metabolism
 要旨: The yeast two-hybrid (Y2H) system is currently one of the most important techniques for protein-protein interaction (PPI) discovery. Here, we describe a stringent three-step Y2H matrix interaction approach that is suitable for systematic PPI screening on a proteome scale. We start with the identification and elimination of autoactivating strains that would lead to false-positive signals and prevent the identification of interactions. Nonautoactivating strains are used for the primary PPI screen that is carried out in quadruplicate with arrayed preys. Interacting pairs of baits and preys are identified in a pairwise retest step. Only PPI pairs that pass the retest step are regarded as potentially biologically relevant interactions and are considered for further analysis.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1007/978-1-61779-455-1_4
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Methods in Molecular Biology
  その他 : Methods Mol. Biol.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Clifton, N.J. : Humana Press
ページ: - 巻号: 812 通巻号: - 開始・終了ページ: 63 - 87 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1064-3745
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954927725544