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  False discovery rate estimation for cross-linked peptides identified by mass spectrometry

Walzthoeni, T., Claassen, M., Leitner, A., Herzog, F., Bohn, S., Förster, F., Beck, M., & Aebersold, R. (2012). False discovery rate estimation for cross-linked peptides identified by mass spectrometry. NATURE METHODS, 9(9), 901-903. doi:10.1038/nmeth.2103.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Walzthoeni, Thomas1, 著者
Claassen, Manfred1, 著者
Leitner, Alexander1, 著者
Herzog, Franz1, 著者
Bohn, Stefan2, 著者           
Förster, Friedrich3, 著者           
Beck, Martin1, 著者
Aebersold, Ruedi1, 著者
所属:
1external, ou_persistent22              
2Baumeister, Wolfgang / Molecular Structural Biology, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565142              
3Förster, Friedrich / Modeling of Protein Complexes, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565148              

内容説明

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キーワード: PROTEIN STRUCTURES; 26S PROTEASOME; LINKING; BIOINFORMATICS; ARCHITECTURE; COMPLEXES; STRATEGY
 要旨: The mass spectrometric identification of chemically cross-linked peptides (CXMS) specifies spatial restraints of protein complexes; these values complement data obtained from common structure-determination techniques. Generic methods for determining false discovery rates of cross-linked peptide assignments are currently lacking, thus making data sets from CXMS studies inherently incomparable. Here we describe an automated target-decoy strategy and the software tool xProphet, which solve this problem for large multicomponent protein complexes.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012-09
 出版の状態: 出版
 ページ: 3
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): ISI: 000308497800022
DOI: 10.1038/nmeth.2103
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: NATURE METHODS
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: MACMILLAN BUILDING, 4 CRINAN ST, LONDON N1 9XW, ENGLAND : NATURE PUBLISHING GROUP
ページ: - 巻号: 9 (9) 通巻号: - 開始・終了ページ: 901 - 903 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1548-7091