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  TREE-PUZZLE: maximum likelihood phylogenetic analysis using quartets and parallel computing

Schmidt, H. A., Strimmer, K., Vingron, M., & von Haeseler, A. (2002). TREE-PUZZLE: maximum likelihood phylogenetic analysis using quartets and parallel computing. Bioinformatics, 18(3), 502-504.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Schmidt, Heiko A.1, 著者
Strimmer, Korbinian, 著者
Vingron, Martin2, 著者           
von Haeseler, Arndt, 著者
所属:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2Gene regulation (Martin Vingron), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479639              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Summary: TREE-PUZZLE is a program package for quartet-based maximum-likelihood phylogenetic analysis (formerly PUZZLE, Strimmer and von Haeseler, Mol. Biol. Evol. , 13, 964–969, 1996) that provides methods for reconstruction, comparison, and testing of trees and models on DNA as well as protein sequences. To reduce waiting time for larger datasets the tree reconstruction part of the software has been parallelized using message passing that runs on clusters of workstations as well as parallel computers. Availability: http://www.tree-puzzle.de. The program is written in ANSI C. TREE-PUZZLE can be run on UNIX, Windows and Mac systems, including Mac OS X. To run the parallel version of PUZZLE, a Message Passing Interface (MPI) library has to be installed on the system. Free MPI implementations are available on the Web (cf. http://www.lam-mpi.org/mpi/implementations/).

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2002-03
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 28994
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Bioinformatics
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 18 (3) 通巻号: - 開始・終了ページ: 502 - 504 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -