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  Maximum-likelihood analysis using TREE-PUZZLE

Schmidt, H. A., & von Haeseler, A. (2003). Maximum-likelihood analysis using TREE-PUZZLE (1st edition). New York [et al]: John Wiley & Sons, Inc.

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Schmidt.pdf (beliebiger Volltext), 330KB
Name:
Schmidt.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
eDoc_access: PUBLIC
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Schmidt, Heiko A.1, Autor
von Haeseler, Arndt, Autor
Affiliations:
1Max Planck Society, ou_persistent13              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: TREE-PUZZLE provides means to analyze and reconstruct evolutionary relationships and trees based on quartets, i.e. groups of 4 sequences. Basic Protocol 1 explains how to reconstruct trees based on the maximum-likelihood principle and quartet puzzling. Basic Protocol 2 discusses likelihood mapping, a method to visualize phylogenetic content in a multiple sequence alignment. Basic Protocol 3 explains how to compare tree topologies using different tests.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2003
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: /
 Ort, Verlag, Ausgabe: New York [et al] : John Wiley & Sons, Inc., 1st edition
 Inhaltsverzeichnis: • Unit Introduction
• Basic Protocol 1: Reconstruct a Phylogenetic Tree
• Basic Protocol 2: Analyze the Content of Phylogenetic Information and the Quartet Support for the Relationship of Groups of Sequences
• Basic Protocol 3: Compare Tree Topologies
• Support Protocol 1: Obtain and Install Tree-Puzzle for Unix/Linux and MacOS X
• Support Protocol 2: Obtain and Install Tree-Puzzle for Macintosh
• Support Protocol 3: Obtain and Install Tree-Puzzle for Windows
• Guidelines for Understanding Results
• Commentary
• Bibliography
Figures (thumbnail)
Figures (full size)
Tables
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 176229
ISBN: 0-471-25093-7
DOI: 10.1002/0471250953.bi0606s01
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Current Protocols in Bioinformatics
Genre der Quelle: Reihe
 Urheber:
Baxevanis, Andreas D., Herausgeber
Davison, Daniel B., Herausgeber
Page, Roderic D.M., Herausgeber
Petsko, Gregory A., Herausgeber
Stein, Lincoln D., Herausgeber
Stormo, Gary D., Herausgeber
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: Unit 6.6 Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: -