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  Automated solid-phase extraction for purification of single nucleotide polymorphism genotyping products prior to matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometric analysis

Sauer, S., Kepper, P., Smyra, A., Dahl, A., Ferse, F.-T., Lehrach, H., & Reinhardt, R. (2004). Automated solid-phase extraction for purification of single nucleotide polymorphism genotyping products prior to matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometric analysis. Journal of Chromatography A, 1049(1-2), 9-16. doi:10.1016/j.chroma.2004.07.069.

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基本情報

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : J Chromatogr A

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作成者

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 作成者:
Sauer, Sascha1, 著者           
Kepper, Pamela2, 著者
Smyra, Anett2, 著者
Dahl, Andreas3, 著者           
Ferse, Falk-Thilo, 著者
Lehrach, Hans3, 著者           
Reinhardt, Richard4, 著者           
所属:
1Nutrigenomics and Gene Regulation (Sascha Sauer), Independent Junior Research Groups (OWL), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479662              
2Max Planck Society, ou_persistent13              
3Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433550              
4High Throughput Technologies, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433552              

内容説明

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キーワード: Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry; Single nucleotide polymorphism; Solid-phase extraction; Genotyping; Purification
 要旨: In this article, we describe the application of a novel micro elution solid-phase extraction method for purification of short stretches of DNA products of single nucleotide polymorphisms (SNPs) prior to MALDI mass spectrometry analysis. An important feature of our method is that the purification columns containing a copolymer of divinylbenzene and N-vinylpyrrolidone can be used several times thereby significantly reducing costs. We implemented this DNA purification technology into a fully automated procedure including molecular biology, MALDI sample preparation, automated mass spectrometric analysis and SNP allele calling by software. Due to the facile purification protocol, the methodology shown could furthermore be used for other applications where efficient medium to high-throughput purification of nucleic acids is required.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2004-09-17
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 230781
DOI: 10.1016/j.chroma.2004.07.069
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Journal of Chromatography A
  出版物の別名 : J Chromatogr A
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 1049 (1-2) 通巻号: - 開始・終了ページ: 9 - 16 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0021-9673