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  The genome of a songbird.

Warren, W. C., Clayton, D. F., Ellegren, H., Arnold, A. P., Hillier, L. W., Kunstner, A., Searle, S., White, S., Vilella, A. J., Fairley, S., Heger, A., Kong, L., Ponting, C. P., Jarvis, E. D., Mello, C. V., Minx, P., Lovell, P., Velho, T. A., Ferris, M., Balakrishnan, C. N., Sinha, S., Blatti, C., London, S. E., Li, Y., Lin, Y. C., George, J., Sweedler, J., Southey, B., Gunaratne, P., Watson, M., Nam, K., Backstrom, N., Smeds, L., Nabholz, B., Itoh, Y., Whitney, O., Pfenning, A. R., Howard, J., Volker, M., Skinner, B. M., Griffin, D. K., Ye, L., McLaren, W. M., Flicek, P., Quesada, V., Velasco, G., Lopez-Otin, C., Puente, X. S., Olender, T., Lancet, D., Smit, A. F., Hubley, R., Konkel, M. K., Walker, J. A., Batzer, M. A., Gu, W., Pollock, D. D., Chen, L., Cheng, Z., Eichler, E. E., Stapley, J., Slate, J., Ekblom, R., Birkhead, T., Burke, T., Burt, D., Scharff, C., Adam, I., Richard, H., Sultan, M., Soldatov, A., Lehrach, H., Edwards, S. V., Yang, S. P., Li, X., Graves, T., Fulton, L., Nelson, J., Chinwalla, A., Hou, S., Mardis, E. R., & Wilson, R. K. (2010). The genome of a songbird. Nature, 464(7289), 757-762. doi:10.1038/nature08819.

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資料種別: 学術論文
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Warren, W. C., 著者
Clayton, D. F., 著者
Ellegren, H., 著者
Arnold, A. P., 著者
Hillier, L. W., 著者
Kunstner, A., 著者
Searle, S., 著者
White, S., 著者
Vilella, A. J., 著者
Fairley, S., 著者
Heger, A., 著者
Kong, L., 著者
Ponting, C. P., 著者
Jarvis, E. D., 著者
Mello, C. V., 著者
Minx, P., 著者
Lovell, P., 著者
Velho, T. A., 著者
Ferris, M., 著者
Balakrishnan, C. N., 著者
Sinha, S., 著者Blatti, C., 著者London, S. E., 著者Li, Y., 著者Lin, Y. C., 著者George, J., 著者Sweedler, J., 著者Southey, B., 著者Gunaratne, P., 著者Watson, M., 著者Nam, K., 著者Backstrom, N., 著者Smeds, L., 著者Nabholz, B., 著者Itoh, Y., 著者Whitney, O., 著者Pfenning, A. R., 著者Howard, J., 著者Volker, M., 著者Skinner, B. M., 著者Griffin, D. K., 著者Ye, L., 著者McLaren, W. M., 著者Flicek, P., 著者Quesada, V., 著者Velasco, G., 著者Lopez-Otin, C., 著者Puente, X. S., 著者Olender, T., 著者Lancet, D., 著者Smit, A. F., 著者Hubley, R., 著者Konkel, M. K., 著者Walker, J. A., 著者Batzer, M. A., 著者Gu, W., 著者Pollock, D. D., 著者Chen, L., 著者Cheng, Z., 著者Eichler, E. E., 著者Stapley, J., 著者Slate, J., 著者Ekblom, R., 著者Birkhead, T., 著者Burke, T., 著者Burt, D., 著者Scharff, C.1, 著者           Adam, I., 著者Richard, H.2, 著者Sultan, M.3, 著者           Soldatov, A.4, 著者           Lehrach, H.5, 著者           Edwards, S. V., 著者Yang, S. P., 著者Li, X., 著者Graves, T., 著者Fulton, L., 著者Nelson, J., 著者Chinwalla, A., 著者Hou, S., 著者Mardis, E. R., 著者Wilson, R. K., 著者 全て表示
所属:
1Dept. of Human Molecular Genetics (Head: Hans-Hilger Ropers), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433549              
2Max Planck Society, ou_persistent13              
3Human Chromosome 21 (Marie-Laure Yaspo), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479652              
4Technology Development(Alexey Soldatov), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479657              
5Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433550              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The zebra finch is an important model organism in several fields with unique relevance to human neuroscience. Like other songbirds, the zebra finch communicates through learned vocalizations, an ability otherwise documented only in humans and a few other animals and lacking in the chicken-the only bird with a sequenced genome until now. Here we present a structural, functional and comparative analysis of the genome sequence of the zebra finch (Taeniopygia guttata), which is a songbird belonging to the large avian order Passeriformes. We find that the overall structures of the genomes are similar in zebra finch and chicken, but they differ in many intrachromosomal rearrangements, lineage-specific gene family expansions, the number of long-terminal-repeat-based retrotransposons, and mechanisms of sex chromosome dosage compensation. We show that song behaviour engages gene regulatory networks in the zebra finch brain, altering the expression of long non-coding RNAs, microRNAs, transcription factors and their targets. We also show evidence for rapid molecular evolution in the songbird lineage of genes that are regulated during song experience. These results indicate an active involvement of the genome in neural processes underlying vocal communication and identify potential genetic substrates for the evolution and regulation of this behaviour.

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出版物名: Nature
  出版物の別名 : Nat
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
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出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 464 (7289) 通巻号: - 開始・終了ページ: 757 - 762 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0028-0836