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  Cultivation-independent characterization of ‘Candidatus Magnetobacterium bavaricum’ via ultrastructural, geochemical, ecological and metagenomic methods

Jogler, C., Niebler, M., Lin, W., Kube, M., Wanner, G., Kolinko, S., Stief, P., Beck, A. J., De Beer, D., Petersen, N., Pan, Y., Amann, R., Reinhardt, R., & Schüler, D. (2010). Cultivation-independent characterization of ‘Candidatus Magnetobacterium bavaricum’ via ultrastructural, geochemical, ecological and metagenomic methods. Environmental Microbiology, 12(9), 2466-2478. doi:10.1111/j.1462-2920.2010.02220.x.

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基本情報

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Environ Microbiol

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作成者

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 作成者:
Jogler, C., 著者
Niebler, M., 著者
Lin, W., 著者
Kube, M.1, 著者           
Wanner, G., 著者
Kolinko, S., 著者
Stief, P., 著者
Beck, A. J., 著者
De Beer, D., 著者
Petersen, N., 著者
Pan, Y., 著者
Amann, R., 著者
Reinhardt, R.1, 著者           
Schüler, D.1, 著者           
所属:
1High Throughput Technologies, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433552              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: ‘Candidatus Magnetobacterium bavaricum’ is unusual among magnetotactic bacteria (MTB) in terms of cell size (8–10 µm long, 1.5–2 µm in diameter), cell architecture, magnetotactic behaviour and its distinct phylogenetic position in the deep-branching Nitrospira phylum. In the present study, improved magnetic enrichment techniques permitted high-resolution scanning electron microscopy and energy dispersive X-ray analysis, which revealed the intracellular organization of the magnetosome chains. Sulfur globule accumulation in the cytoplasm point towards a sulfur-oxidizing metabolism of ‘Candidatus M. bavaricum’. Detailed analysis of ‘Candidatus M. bavaricum’ microhabitats revealed more complex distribution patterns than previously reported, with cells predominantly found in low oxygen concentration. No correlation to other geochemical parameters could be observed. In addition, the analysis of a metagenomic fosmid library revealed a 34 kb genomic fragment, which contains 33 genes, among them the complete rRNA gene operon of ‘Candidatus M. bavaricum’ as well as a gene encoding a putative type IV RubisCO large subunit.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2010-09
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Environmental Microbiology
  出版物の別名 : Environ Microbiol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 12 (9) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2466 - 2478 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1462-2912