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  ConsensusPathDB: toward a more complete picture of cell biology

Kamburov, A., Pentchev, K., Galicka, H., Wierling, C., Lehrach, H., & Herwig, R. (2011). ConsensusPathDB: toward a more complete picture of cell biology. Nucleic Acids Research, 39(Database issue), D712-7. Retrieved from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21071422 http://nar.oxfordjournals.org/content/39/suppl_1/D712.full.pdf.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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 作成者:
Kamburov, A.1, 著者           
Pentchev, K.2, 著者           
Galicka, H.1, 著者           
Wierling, C.3, 著者           
Lehrach, H.2, 著者           
Herwig, R., 著者
所属:
1Bioinformatics (Ralf Herwig), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479648              
2Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433550              
3Systems Biology (Christoph Wierling), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479656              

内容説明

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キーワード: Animals; *Databases, Factual; Databases, Genetic; Gene Expression; *Gene Regulatory Networks; Humans; Internet; *Metabolic Networks and Pathways; Mice; *Protein Interaction Mapping; *Signal Transduction; User-Computer Interface
 要旨: ConsensusPathDB is a meta-database that integrates different types of functional interactions from heterogeneous interaction data resources. Physical protein interactions, metabolic and signaling reactions and gene regulatory interactions are integrated in a seamless functional association network that simultaneously describes multiple functional aspects of genes, proteins, complexes, metabolites, etc. With 155,432 human, 194,480 yeast and 13,648 mouse complex functional interactions (originating from 18 databases on human and eight databases on yeast and mouse interactions each), ConsensusPathDB currently constitutes the most comprehensive publicly available interaction repository for these species. The Web interface at http://cpdb.molgen.mpg.de offers different ways of utilizing these integrated interaction data, in particular with tools for visualization, analysis and interpretation of high-throughput expression data in the light of functional interactions and biological pathways.

資料詳細

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 日付: 2011
 出版の状態: 出版
 ページ: -
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 査読: -
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nucleic Acids Research
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 39 (Database issue) 通巻号: - 開始・終了ページ: D712 - 7 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1362-4962 (Electronic) 0305-1048 (Linking)