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  De novo analysis of electron impact mass spectra using fragmentation trees

Hufsky, F., Rempt, M., Rasche, F., Pohnert, G., & Böcker, S. (2012). De novo analysis of electron impact mass spectra using fragmentation trees. Analytica Chimica Acta, 39, 67-76. doi:10.1016/j.aca.2012.06.021.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000F-EDE0-A 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0009-33A3-5
資料種別: 学術論文

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IMPRS033.pdf (出版社版), 2MB
 
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IMPRS033.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Chemical Ecology, MJCO; )
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IMPRS033s1.pdf (付録資料), 337KB
 
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IMPRS033s1.pdf
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閲覧制限:
制限付き (Max Planck Institute for Chemical Ecology, MJCO; )
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application/pdf
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-
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-
CCライセンス:
-
:
IMPRS033s2.pdf (付録資料), 3MB
 
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IMPRS033s2.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Chemical Ecology, MJCO; )
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-
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-

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作成者

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 作成者:
Hufsky, Franziska1, 著者           
Rempt, Martin, 著者
Rasche, Florian, 著者
Pohnert, Georg2, 著者           
Böcker, Sebastian, 著者
所属:
1IMPRS on Ecological Interactions, MPI for Chemical Ecology, Max Planck Society, ou_421900              
2External Organizations, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The automated fragmentation analysis of high resolution EI mass spectra based on a fragmentation tree algorithm is introduced. Fragmentation trees are constructed from EI spectra by automated signal extraction and evaluation. These trees explain relevant fragmentation reactions and assign molecular formulas to fragments. The method enables the identification of the molecular ion and the molecular formula of a metabolite if the molecular ion is present in the spectrum. These identifications are independent of existing library knowledge and, thus, support assignment and structural elucidation of unknown compounds. The method works even if the molecular ion is of very low abundance or hidden under contaminants with higher masses. We apply the algorithm to a selection of 50 derivatized and underivatized metabolites and demonstrate that in 78% of cases the molecular ion can be correctly assigned. The automatically constructed fragmentation trees correspond very well to published mechanisms and allow the assignment of specific relevant fragments and fragmentation pathways even in the most complex EI-spectra in our dataset. This method will be very helpful in the automated analysis of metabolites that are not included in common libraries and it thus has the potential to support the explorative character of metabolomics studies.

資料詳細

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言語:
 日付: 2012-06-122012-07-272012
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: その他: IMPRS033
DOI: 10.1016/j.aca.2012.06.021
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Analytica Chimica Acta
  省略形 : Anal. Chim. Acta
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Amsterdam : Elsevier
ページ: - 巻号: 39 通巻号: - 開始・終了ページ: 67 - 76 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 0003-2670
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925379952