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  Molecular analysis of enrichment cultures of ammonia oxidizers from the Salar de Huasco, a high altitude saline wetland in northern Chile

Dorador, C., Busekow, A., Vila, I., Imhoff, J. F., & Witzel, K.-P. (2008). Molecular analysis of enrichment cultures of ammonia oxidizers from the Salar de Huasco, a high altitude saline wetland in northern Chile. Extremophiles, 12(3), 405-414. doi:10.1007/s00792-008-0146-x.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000F-D6B1-2 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000F-D6B2-F
資料種別: 学術論文

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:
Dorador, C., et al., 2008, S-38761.pdf (出版社版), 285KB
 
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-
ファイル名:
Dorador, C., et al., 2008, S-38761.pdf
説明:
-
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閲覧制限:
制限付き (Max Planck Institute for Evolutionary Biology, MPLM; )
MIMEタイプ / チェックサム:
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技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Dorador, Cristina1, 著者           
Busekow, Annika1, 著者           
Vila, Irma, 著者
Imhoff, Johannes F., 著者
Witzel, Karl-Paul1, 著者           
所属:
1Department Ecophysiology, Max Planck Institute for Limnology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_976547              

内容説明

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キーワード: ammonia-oxidizing bacteria; 16S rDNA; amoA gene; andean altiplano; salinity
 要旨: We analyzed enrichment cultures of ammonia-oxidizing bacteria (AOB) collected from different areas of Salar de Huasco, a high altitude, saline, pH-neutral water body in the Chilean Altiplano. Samples were inoculated into mineral media with 10 mM NH4+ at five different salt concentrations (10, 200, 400, 800 and 1,400 mM NaCl). Low diversity (up to three phylotypes per enrichment) of beta-AOB was detected using 16S rDNA and amoA clone libraries. Growth of beta-AOB was only recorded in a few enrichment cultures and varied according to site or media salinity. In total, five 16S rDNA and amoA phylotypes were found which were related to Nitrosomonas europaea/Nitrosococcus mobilis, N. marina and N. communis clusters. Phylotype 1-16S was 97% similar with N. halophila, previously isolated from Mongolian soda lakes, and phylotypes from amoA sequences were similar with yet uncultured beta-AOB from different biofilms. Sequences related to N. halophila were frequently found at all salinities. Neither gamma-AOB nor ammonia-oxidizing Archaea were recorded in these enrichment cultures.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2008-05
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 361812
DOI: 10.1007/s00792-008-0146-x
その他: 2598/S 38761
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Extremophiles
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 12 (3) 通巻号: - 開始・終了ページ: 405 - 414 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1431-0651