Better Filtering with Gapped q-Grams

Burkhardt, Stefan; Kärkkäinen, Juha

Better Filtering with Gapped q-Grams

Burkhardt, S., & Kärkkäinen, J. (2001). Better Filtering with Gapped q-Grams. In A., Amir, & G., Landau (Eds.), Proceedings of the 12th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (pp. 73-85). Berlin, Germany: Springer.

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000F-3179-D 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000F-317B-9

資料種別: 会議論文

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Burkhardt, Stefan¹, 著者
Kärkkäinen, Juha¹, 著者

所属:
1Algorithms and Complexity, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_24019

内容説明

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キーワード: -

要旨: The q-gram filter is a popular filtering method for approximate string matching. It compares substrings of length q (the q-grams) in the pattern and the text to identify the text areas that might contain a match. A generalization of the method is to use gapped q-grams, subsets of q characters in some fixed non-contiguous shape, instead of contiguous substrings. Although mentioned a few times in the literature, this generalization has never been studied in any depth. In ths paper, we report the first results from a study on gapped q-grams. We show that gapped q-grams can provide orders of magnitude faster and/or more efficient filtering than contiguous q-grams. The performance, however, depends on the shape of the q-grams. The best shaoes are rare and often posess no apparen regularity. We show how to recognize good shapes and demonstrate with experiments their advantage over both contiguous and average shapes. We concentrate here on the k mismatches problem, but also outline an approach for extending the results to the more common k differences problem.

資料詳細

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言語: eng - English

日付: 修正: 2010-03-02出版: 2001

出版の状態: 出版

ページ: -

出版情報: -

目次: -

査読: -

識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 518175
URI: http://www.mpi-sb.mpg.de/~stburk/gapped-q.ps
その他: Local-ID: C1256428004B93B8-5165C4C93C02B85DC1256A8F00420FEE-Burkhardt2001

学位: -

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出版物 1

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出版物名: Proceedings of the 12th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching

種別: 会議論文集

著者・編者:
Amir, Amihood, 編集者
Landau, Gadi, 編集者

所属:
-

出版社, 出版地: Berlin, Germany : Springer

ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 73 - 85 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISBN: 3-540-42271-4

出版物 2

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出版物名: Lecture Notes in Computer Science

種別: 連載記事

著者・編者:

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出版社, 出版地: -

ページ: - 巻号: 2089 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -

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