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  Functional evaluation of domain-domain interactions and human protein interaction networks

Schlicker, A., Huthmacher, C., Ramírez, F., Lengauer, T., & Albrecht, M. (2006). Functional evaluation of domain-domain interactions and human protein interaction networks. In German Conference on Bioinformatics (GCB 2006) (pp. 115-126). Bonn, Germany: Gesellschaft für Informatik.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000F-22F2-9 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000F-22F3-7
資料種別: 会議論文

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作成者

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 作成者:
Schlicker, Andreas1, 著者           
Huthmacher, Carola1, 著者           
Ramírez, Fidel2, 著者
Lengauer, Thomas1, 著者           
Albrecht, Mario1, 著者           
Huson, Daniel, 編集者
Kohlbacher, Oliver3, 編集者           
Lupas, Andrei, 編集者
Nieselt, Kay, 編集者
Zell, Andreas, 編集者
所属:
1Computational Biology and Applied Algorithmics, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_40046              
2Max Planck Society, ou_persistent13              
3Algorithms and Complexity, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_24019              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Large amounts of protein and domain interaction data are being produced by experimental high-throughput techniques and computational approaches. To gain insight into the value of the provided data, we used our new similarity measure based on the Gene Ontology to evaluate the molecular functions and biological processes of interacting proteins or domains. The applied measure particularly addresses the frequent annotation of proteins or domains with multiple Gene Ontology terms. Using our similarity measure, we compare predicted domain-domain and human protein-protein interactions with experimentally derived interactions. The results show that our similarity measure is of significant benefit in quality assessment and confidence ranking of domain and protein networks. We also derive useful confidence score thresholds for dividing domain interaction predictions into subsets of low and high confidence.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2007-03-202006
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: Bonn, Germany : Gesellschaft für Informatik
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 314486
その他: Local-ID: C125673F004B2D7B-D2C0097D30CFFE37C12571F600452604-Albrecht2006h
 学位: -

関連イベント

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イベント名: Untitled Event
開催地: Tübingen, Germany
開始日・終了日: 2006-09-19

訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: German Conference on Bioinformatics (GCB 2006)
種別: 会議論文集
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Bonn, Germany : Gesellschaft für Informatik
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 115 - 126 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISBN: 978-3-88579-177-5

出版物 2

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出版物名: Lecture Notes in Informatics
種別: 連載記事
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -