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  A Fully Computational Model for Predicting Percutaneous Drug Absorption

Neumann, D., Kohlbacher, O., Merkwirth, C., & Lengauer, T. (2006). A Fully Computational Model for Predicting Percutaneous Drug Absorption. Journal of Chemical Information and Modeling, 1, 424-429.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Neumann, Dirk, 著者
Kohlbacher, Oliver1, 著者           
Merkwirth, Christian2, 著者           
Lengauer, Thomas2, 著者           
所属:
1Algorithms and Complexity, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_24019              
2Computational Biology and Applied Algorithmics, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_40046              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The prediction of transdermal absorption for arbitrary penetrant structures has several important applications in the pharmaceutical industry. We propose a new data-driven, predictive model for skin permeability coefficients kp based on an ensemble model using k-nearest-neighbor models and ridge regression. The model was trained and validated with a newly assembled data set containing experimental data and structures for 110 compounds. On the basis of three purely computational descriptors (molecular weight, calculated octanol/water partition coefficient, and solvation free energy), we have developed a model allowing for the reliable, purely computational prediction of skin permeability coefficients. The model is both accurate and robust, as we showed in an extensive validation (correlation coefficient for leave-one-out cross validation: Q = 0.948, mean standard error: 0.2 for log kp).

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2007-04-262006
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 314566
その他: Local-ID: C125673F004B2D7B-8AE53C81163A6135C1257289003128A2-Lengauer2006c
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Journal of Chemical Information and Modeling
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 1 通巻号: - 開始・終了ページ: 424 - 429 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -