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  The implications of alternative splicing in the ENCODE protein complement

Tress, M. L., Martelli, P. L., Frankish, A., Reeves, G. A., Wesselink, J. J., Yeats, C., Ólason, P. Í., Albrecht, M., Hegyi, H., Giorgetti, A., Raimondo, D., Lagarde, J., Laskowski, R. A., López, G., Sadowski, M. I., Watson, J. D., Fariselli, P., Rossi, I., Nagy, A., Kai, W., Størling, Z., Orsini, M., Assenov, Y., Blankenburg, H., Huthmacher, C., Ramírez, F., Schlicker, A., Denoued, F., Jones, P., Kerrien, S., Orchard, S., Antonarakis, S. E., Reymond, A., Birney, E., Brunak, S., Casadio, R., Guigo, R., Harrow, J., Hermjakob, H., Jones, D. T., Lengauer, T., Orengo, C. A., Patthy, L., Thornton, J. M., Tramontano, A., & Valencia, A. (2007). The implications of alternative splicing in the ENCODE protein complement. Proceedings of the National Academy of Sciences, 104(13), 5495-5500. doi:10.1073/pnas.0700800104.

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資料種別: 学術論文

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Albrecht2007c.pdf (出版社版), 5KB
 
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Albrecht2007c.pdf
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 作成者:
Tress, Michael L., 著者
Martelli, Pier L., 著者
Frankish, Adam, 著者
Reeves, Gabrielle A., 著者
Wesselink, Jan J., 著者
Yeats, Corin, 著者
Ólason, Páll Í., 著者
Albrecht, Mario1, 著者           
Hegyi, Hedi, 著者
Giorgetti, Alejandro, 著者
Raimondo, Domenico, 著者
Lagarde, Julien, 著者
Laskowski, Roman A., 著者
López, Gonzalo, 著者
Sadowski, Michael I., 著者
Watson, James D., 著者
Fariselli, Piero, 著者
Rossi, Ivan, 著者
Nagy, Alinda, 著者
Kai, Wang, 著者
Størling, Zenia, 著者Orsini, Massimiliano, 著者Assenov, Yassen1, 2, 著者           Blankenburg, Hagen1, 2, 著者           Huthmacher, Carola1, 著者           Ramírez, Fidel3, 著者Schlicker, Andreas1, 著者           Denoued, France, 著者Jones, Phil, 著者Kerrien, Samuel, 著者Orchard, Sandra, 著者Antonarakis, Stylianos E., 著者Reymond, Alexandre, 著者Birney, Ewan, 著者Brunak, Søren, 著者Casadio, Rita, 著者Guigo, Roderic, 著者Harrow, Jennifer, 著者Hermjakob, Henning, 著者Jones, David T., 著者Lengauer, Thomas1, 著者           Orengo, Christine A., 著者Patthy, László, 著者Thornton, Janet M., 著者Tramontano, Anna, 著者Valencia, Alfonso, 著者 全て表示
所属:
1Computational Biology and Applied Algorithmics, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_40046              
2International Max Planck Research School, MPI for Informatics, Max Planck Society, ou_1116551              
3Max Planck Society, ou_persistent13              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Alternative premessenger RNA splicing enables genes to generate more than one gene product. Splicing events that occur within protein coding regions have the potential to alter the biological function of the expressed protein and even to create new protein functions. Alternative splicing has been suggested as one explanation for the discrepancy between the number of human genes and functional complexity. Here, we carry out a detailed study of the alternatively spliced gene products annotated in the ENCODE pilot project. We find that alternative splicing in human genes is more frequent than has commonly been suggested, and we demonstrate that many of the potential alternative gene products will have markedly different structure and function from their constitutively spliced counterparts. For the vast majority of these alternative isoforms, little evidence exists to suggest they have a role as functional proteins, and it seems unlikely that the spectrum of conventional enzymatic or structural functions can be substantially extended through alternative splicing .

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2008-02-282007
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 356659
DOI: 10.1073/pnas.0700800104
その他: Local-ID: C12573CC004A8E26-67A2E9CA60FAAE03C12572A4003BF017-Albrecht2007c
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Proceedings of the National Academy of Sciences
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 104 (13) 通巻号: - 開始・終了ページ: 5495 - 5500 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0027-8424